基于全基因组SNP分析的继代培养香菇菌株退化机制研究

发布时间：2020年03月11日 07:30　　浏览次数：690

●项目名称：基于全基因组SNP分析的继代培养香菇菌株退化机制研究

●项目类别：北京市自然科学基金青年项目

●起止时间：2020-2021

●主要内容：

采用PDA培养基对香菇菌种进行连续继代培养，分析测定不同继代培养次数的菌株在拮抗反应、菌丝生长速率及菌丝外观形态、亚细胞结构、胞外酶/保护酶活力和子实体形成能力等方面的差异，解析连续继代培养对香菇菌株生物学性状的影响。对于不同继代培养次数的香菇菌株进行全基因组重测序。与参考基因组进行比对，进行SNP检测及注释。通过进化树、群体结构、核酸多态性(ェ)、固定指数(FBt)等对不同继代次数菌株进行群体遗传结构分析。根据选择消除分析等结果，筛选连续继代培养选择压力下基因组受到强选择的区域，进行功能富集分析，并进一步关联继代培养过程中相关退化性状，挖掘关键功能基因。根据功能基因设计分子标记，扩大群体规模，验证分子标记在继代培养退化菌株中的特异性。从而明确基因突变在香菇连续继代培养中积累规律，揭示继代过程中香菇菌株的进化和选择机制。

●项目主持人：

严冬：助理研究员，主要从事香菇等食用菌菌种质量检测及退化机理的研究。