刺芹侧耳抗软腐病相关基因的挖掘及功能解析

发布时间：2020年03月11日 07:27　　浏览次数：926

●项目名称：刺芹侧耳抗软腐病相关基因的挖掘及功能解析（31701975）

●项目类别：国家自然科学基金青年基金

●起止时间：2018-2020

●主要内容：

刺芹侧耳（杏鲍菇）软腐病是近年来发生的新病害，已在韩国和我国多地爆发，导致刺芹侧耳减产15～20%。本项目组前期研究发现，国内流行的病原菌为北京泛菌（更名为北京欧文氏菌），迄今尚无刺芹侧耳软腐病抗病基因的报道。为寻求抗病育种的新思路，在完成对病原菌基因组测序及生物信息学预测的基础上，分析发现其具有364个Ⅲ型效应蛋白。鉴于抗病蛋白与Ⅲ型效应蛋白的相互作用是二者最重要的直接识别方式，因此，本项目采用基于同源蛋白映射和结构域互作两种方法构建北京泛菌Ⅲ型效应蛋白与刺芹侧耳的蛋白互作网络，由此分析并锁定Ⅲ型效应蛋白与抗病蛋白保守结构域的蛋白的互作，通过细菌双杂交和pull-down等方法验证蛋白互作特性，从而筛选并获得刺芹侧耳抗软腐病的目标基因，并对其进行功能验证。本研究不仅可探究该病原菌与宿主的相互作用机制，也可为刺芹侧耳的抗病育种和病原防控措施研发提供理论依据和相关思路。

●项目主持人：

荣成博：副研究员，主要从事食用菌遗传育种相关研究。